Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tgfbr3lD3YZZ2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tgfbr3lD3YZZ2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfbr3lD3YZZ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms