Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc6D3YZP9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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