Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc170D3YXL0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms