Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms