Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc13D3YV10 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms