Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatipB9EKE5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatipB9EKE5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms