Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mterf1bB9EJ57 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms