Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Phf11cB4XVP9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms