Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cspp1B2RX88 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cspp1B2RX88 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms