Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf3B2RUQ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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