Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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