Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf518aB2RRF6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms