Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf1B2RRD7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf1B2RRD7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms