Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf3B2RQG2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf3B2RQG2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms