Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms