Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H60cB1B213 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms