Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm2012B1B0R1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm2012B1B0R1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms