Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd5B1AYB6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd5B1AYB6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms