Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms