Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssxa1B1AUS7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssxa1B1AUS7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ssxa1B1AUS7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxa1B1AUS7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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