Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spocd1B1ASB6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms