Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef20B1ARV6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pramef20B1ARV6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms