Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samt1A2BED8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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