Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Rtf1A2AQ19 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Rtf1A2AQ19 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rtf1A2AQ19 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms