Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syndig1A2ANU3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1A2ANU3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms