Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmpd1A2AKB4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmpd1A2AKB4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms