Protein–RNA interactions for Protein: A2AJA7

Mamdc4, Apical endosomal glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 1,228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mamdc4A2AJA7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mamdc4A2AJA7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mamdc4A2AJA7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms