Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prdm12A2AJ77 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm12A2AJ77 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms