Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdccag3A2AIW0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdccag3A2AIW0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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