Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramel3A2AHA7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms