Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc163A2AGD7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms