Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdl2A2AGA4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl2A2AGA4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms