Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Tbc1d16A2ABG4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d16A2ABG4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d16A2ABG4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms