Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm16A2A935 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm16A2A935 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms