Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RlfA2A7F4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms