Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo47A2A6H3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms