Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cul4bA2A432 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms