Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkd2l1A2A259 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkd2l1A2A259 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms