Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nlrp1bA1Z198 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nlrp1bA1Z198 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms