Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssc4dA1L0T3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms