Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms