Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms