Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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