Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2LB96

Trbv29, T cell receptor beta, variable 29 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv29A0A0G2LB96 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv29A0A0G2LB96 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv29A0A0G2LB96 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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