Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms