Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms