Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
HERC1Q15751 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.45
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HERC1Q15751 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
HERC1Q15751 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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