Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TAF1AQ15573 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TAF1AQ15573 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms