Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCINQ13939 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCINQ13939 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms