Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRIG3Q6UXM1 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms